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2000年以来西安交通大学历任校长如下：
西安交通大学第四十一任校长王树国(2014年春 -至今)
王树国，男，汉族，河北献县人，1958年10月生，1973年6月参加工作，1976年11月入党。研究生学历，工学博士学位。哈尔滨工业大学机械工程系机电控制及自动化专业毕业。生物医学仪器与工程学科教授，博士生导师。
现任西安交通大学校长（副部长级）、党委副书记。
西安交通大学第四十任校长郑南宁(2003年秋 – 2014年春)
郑南宁，男，汉族，祖籍陕西西安，1952年12月19日出生于江苏省南京市，人工智能、计算机视觉与模式识别专家，IEEE fellow，中国工程院院士，西安交通大学人工智能与机器人研究所所长，西安交通大学原校长。
郑南宁于1975年10月本科毕业于西安交通大学工业自动化专业；1981年5月硕士毕业于西安交通大学自动控制理论及应用专业；1985年3月博士毕业于日本应庆大学电机工程系；1994年6月至1996年5月任西安交通大学电子与信息工程学院副院长；1995年11月至2003年5月任西安交通大学副校长；2002年至2014年任陕西省科学技术协会主席；2003年8月至2014年4月任西安交通大学校长兼西安交通大学研究生院院长；2014年4月任西安交通大学人工智能与机器人研究所所长。
郑南宁长期从事人工智能与模式识别、计算机视觉及其先进计算架构的应用基础理论与工程技术的研究。
西安交通大学第三十九任校长徐通模(1998年春-2003年秋)
徐通模，男，汉族，1939年11月生于江苏如皋，西安交通大学能源与动力工程学院教授、博士生导师，西安交通大学原校长。
徐通模于1961年7月毕业于西安交通大学动力系锅炉制造专业并留校任教；1983年12月至1988年10月任西安交通大学能源系主任；1988年7月至1995年11月任西安交通大学副校长；1998年1月至2003年8月任西安交通大学校长。
徐通模长期从事热能动力工程学科的教学和科研工作。
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